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Gemstone/S hat die Rolle der Anwendungsdatenbank in PAS für den laufenden Betrieb. Die Grundidee ist dabei, daß nur der laufende Betrieb in Gemstone abgebildet wird (Datenbankgröße !), aber veraltete oder aktuelle Daten sollten nach PostgreSQL exportiert werden und dort zur Auswertung zur Verfügung stehen.
In Gemstone/S läuft auch die Anwendungslogik. Die Anwendung ist komplett API getrieben - lediglich Topaz-Skripte können an der API vorbei Aktionen durchführen.